在中国民航确认的18个高原机场中，东航云南公司运行的高原机场有11个，分别是：拉萨（3570米）、九寨黄龙（3448米）、迪庆（3287米）、丽江（2243米）、大理（2155米）、攀枝花（1980米）、兰州（1947米）、昭通（1935米）、昆明（1895米）、临沧（1869米）、保山（1663米）。其中拉萨、九寨黄龙、迪庆为高高原机场。

东航云南公司地处云贵高原，高原机场运行的飞行时间及起降架次约占公司总飞行时间及架次的20%和40%。为确保飞行安全，云南分公司对高原机场运行非常重视，从高原机场飞行、机场特殊性、安全运行管理、飞行技术管理、工程维修管理、运行控制管理等方面积极研究和实践，制定安全运行管理规程，科学组织训练，合理安排航班生产，在确保飞行安全的基础上，努力提高经济效益。

东航云南分公司严格运行合格审定和持续做好运行监督检查。运行的所有高原机场均通过了局方的运行合格审定，对于拉萨、九黄等高高原机场还按照总局《关于对航空公司运营九寨/黄龙等高原机场进行补充合格审定的批复》要求，配合民航西南管理局完成了补充合格审定，并接受局方的持续监督检查，正式开航前严格按照新开航线运行合格程序的要求分阶段、按步骤，精心部署、充分准备，在验证飞行阶段分别进行了模拟机训练和不载客验证飞行。在接受局方监督的同时，云南分公司加强公司内部的高原机场运行监督检查力度，对存在执行规章不严、不遵守运行标准等问题的部门及人员及时进行通报和处理，并对其整改完成情况进行跟踪复查，做到了既有利于保证飞行安全，又不更多地影响经济效益