民航运输机水系统包括饮用水系统和污水系统。污水系统包括废水系统和马桶污水系统：废水系统收集厨房和厕所洗手盆用过的废水和舱门门槛处的雨水，并通过排放口排到机外；马桶污水系统抽吸冲刷马桶后的污水，将其暂时存储在污水箱内，飞机勤务时由污水车抽走。

　　1、废水排放系统

　　在厕所和厨房分别设置了废水排放口，通过机身下部装有废水排放竖管，排出机外。

　　另外，在登机门和厨房勤务门的门槛内侧，地板上设有雨水收集沟，收集沟两端有排水孔连接到废水排放管道，经过一个储水囊，连接到机外排水口。

　　2、马桶污水系统

　　每个厕所都有一套马桶污水系统，来存储冲刷马桶的污水。现在许多飞机厕所采用更加卫生、省水的真空污水系统。冲洗马桶的水不是来自污水箱内的污水，而是来自饮用水系统的洁净水，大大改善冲洗的卫生条件。

　　冲洗后，所有污物进入污水箱储存起来，当飞机在地面时，可通过污水车抽走污水箱内的污物，并通过清洗接头对污水箱进行清洗。